公孔雀的生殖系统包括睾丸、睾丸旁导管系统(附睾)、输精管和交媾器(阴茎体),但是雄孔雀没有一般哺乳动物所具有的副性腺和精索两种结构。
睾丸:雄孔雀的睾丸呈豌豆形且左右对称,其位置是在腹腔体中线背系膜两侧的肠腔背侧且由睾丸系膜连接,右侧睾丸稍小于左侧睾丸。雄孔雀睾丸的大小不是一成不变的,会随着年龄和性活动的改变而有较大改变。刚孵出的孔雀睾丸较小,随着年龄的增长而增大且在发情期明显增大。睾丸的生物学功能是分泌雄性激素和产生精子,但在睾丸内精子的受精能力极低,需在雌孔雀生殖道中获能后才具有受精能力。
睾丸旁导管系统:雄孔雀的附睾没有头、体、尾之分,仅仅是位于睾丸后内侧形似长纺锤形的膨大凸起部。这个膨大凸起由4部分组成:一是睾丸网;二是输出小管;三是附睾小管;四是附睾管,凸起的前部被肾上腺被囊包裹。
在非发情期,睾丸旁导管系统小而不明显。
输精管:雄孔雀的输精管呈极为弯曲的细导管状,其生物学功能是贮存精子,也是精子的排出导管。雄孔雀输精管前面是附睾管,后面是随着肾脏内侧的腹面和同侧的输尿管一同向前,在骨盆部位膨大为纺锤形,终止于泄殖腔背侧,之后形成的是输精管乳头,其位置是泄殖道交外侧壁有输尿管开端的腹内侧。
交媾器:雄性孔雀并没有完整的阴茎,却有一整套交媾器,其位置是泄殖腔后面的腹区。当雄孔雀处于性静止的时期,交媾器隐藏在泄殖腔里面,其结构有以下几个组成:一是输精管乳头;二是脉管体;三是阴茎;四是淋巴嬖。孔雀阴茎体只在刚孵出的雄孔雀中较为明显,位于肛道的腹侧,所以可利用这一点对雏孔雀进行早期雌雄鉴别,以利于生产的需要。
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