雌性孔雀的生殖系统仅左侧卵巢和输卵管正常发育,经过进化雌孔雀右侧卵巢和输卵管已经逐渐退化。雌孔雀左侧卵巢被卵巢系膜悬挂在腹腔内,位置是背系膜的左边;其前部和左肺相连;腹侧紧挨着腺胃和脾脏。雌孔雀卵巢的体积和外形随着年龄的增长和机能状态的发展而有很大的变化。幼雌孔雀卵巢较小,但随着年龄的增长而增大,到产卵时,常见几个体积依次递增的大卵泡以极短的柄与卵巢紧接。雌孔雀停产后,卵巢的形状和大小就恢复到静止期。
雌性孔雀输卵管只有左侧正常发育,且是一个弯曲的管道,起于卵巢的后方,在腹腔左背侧延体壁向后延伸,输卵管止于泄殖腔部。输卵管的长度随着年龄和不同的生理阶段而有所不同,刚刚出生的雌孔雀体内的输卵管是一条很细、很直、管壁很薄的细小管道,会随年龄增长而变得厚、粗,其形状长而弯曲。根据形态结构和功能特点可将输卵管分为以下几个部分:一是漏斗部,二是蛋白分泌部,三是峡部,四是子宫,五是阴道。输卵管的漏斗部在卵巢正后方,其生物学功能是提供精子和卵子受精的场地。输卵管的漏斗部其前端呈扩大的漏斗形状,它的游离边是薄且软的皱嬖结构,被称为输卵管伞部。输卵管伞部的生物学功能是接收从卵巢上排出的成熟卵泡。输卵管的蛋白分泌部具有特定的形状,呈长而弯曲的形态,其生物学功能是分泌蛋清,其特征是管径大、厚管壁。输卵管的峡部形态又窄又短,生理位置是在蛋白分泌部和子宫的中间,其管壁薄而坚实,是形成卵内、外壳膜的场所。输卵管的子宫位于输卵管下部的膨大部分呈扩大成囊状,子宫壁较厚,卵在子宫内停留时间较长。子宫是形成蛋壳的场所。
孔雀输卵管的阴道位于子宫和泄殖腔之间,其特点是厚壁和管窄,开口于泄殖腔的左侧壁,也是输卵管的终端,其形态特点是s形特有弯曲。阴道的肌层很发达,卵经过阴道的时间仅1分钟左右。
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