矮马大肠中的纤维素

动物区系矮马大肠中的原生动物数量约为10级，也就是每毫升内容物中有0.5 x I0,〜1.5 x I0,个。然而原生动物个体上远大于细菌，因此它们对矮马大肠内容物贡献的生物量相近，它们对代谢的贡献更少，因为代谢作用大致与表面积成正比。动物区系的种类与瘤胃稍不同。约72种原生动物，主要是纤毛虫，被认为是矮马大肠的更常见栖息者，在不同室间具有一些种类差异。发现在设特兰矮马中，原生动物来自于下列属：布契利虫属圆茎纤虫属 x毛盔纤毛虫属 和一部分的亚等笔滴虫属。驱除原生动物只能引起干物质消化的略微下降，对细菌数量或纤维素消化无影响。